细菌模型包含课程和文献中涉及到的细菌，可直观展示细菌的构造，对各种细菌的结构进行分层式讲解。

点击细菌模型按钮，在平台内容编辑区内会自动生成一个细菌模型的快捷方式，课件保存后再次使用时直接双击该快捷方式即可将细菌模型打开。模型加载后自动在新界面中打开。

与人体模型的界面分布相同，细菌模型的界面也分为三个部分，左侧为模型展示区，右侧上半部为操作命令区，下半部为器官列表区。

进入模型后，首先需选择要查看的细菌，在细菌名称上双击，该细菌的全部结构就展现在展示区内了，鼠标滑过模型会出现对应部位的名称，在模型上单击鼠标左键点击区域变成蓝色，表明该器官被选中，双击鼠标左键，则该器官居中放大呈现，在空白处按住鼠标右键，可将模型进行旋转，按住鼠标中键，可将模型进行平移。

软件默认的背景色为黑色，可通过右上角的颜色拾取器自行切换。操作命令区内的命令均为互斥按钮，如选中某一具体结构点击隐藏，此时显示按钮可用，点击显示则隐藏的结构再次出现。再如点击透明按钮，该结构透明，此时不透明按钮可用，点击不透明则取消透明的操作。

细菌列表区中共有50种细菌，双击细菌名称后，该细菌的细分结构展开，可通过点击细分结构名称前的方框来控制该结构的显示与隐藏。选中某一细胞后，将操作命令区上方的显示信息栏勾选上可查看该细菌的相关信息。